Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PtprbB2RU80 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms