Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prrt4B2RU40 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms