Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zbed5B2RPU8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zbed5B2RPU8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms