Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms