Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprsB0V2N1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprsB0V2N1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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