Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Skint5A7XUY5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Skint5A7XUY5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint5A7XUY5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint5A7XUY5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint5A7XUY5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint5A7XUY5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint5A7XUY5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint5A7XUY5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint5A7XUY5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Skint5A7XUY5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Skint5A7XUY5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skint5A7XUY5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Skint5A7XUY5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms