Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pm20d2A3KG59 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pm20d2A3KG59 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms