Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm6880A3KG45 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms