Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp8b5A3FIN4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Atp8b5A3FIN4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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Atp8b5A3FIN4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Atp8b5A3FIN4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Atp8b5A3FIN4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Atp8b5A3FIN4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp8b5A3FIN4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp8b5A3FIN4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
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