Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CatsperbA2RTF1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms