Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scn3aA2ASI5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scn3aA2ASI5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms