Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb1A2AQ07 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb1A2AQ07 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms