Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhox3fA2ANE1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhox3fA2ANE1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms