Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GabreA2AMW3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GabreA2AMW3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms