Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SetxA2AKX3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SetxA2AKX3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms