Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FocadA2AKG8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FocadA2AKG8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms