Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Frmpd1A2AKB4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Frmpd1A2AKB4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Frmpd1A2AKB4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms