Protein–RNA interactions for Protein: A2AF28

Slc25a53, MCG115034, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a53A2AF28 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc25a53A2AF28 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms