Protein–RNA interactions for Protein: A2AAE1

Kiaa1109, Uncharacterized protein KIAA1109, mousemouse

Predictions only

Length 5,005 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1109A2AAE1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kiaa1109A2AAE1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms