Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb4A2A863 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb4A2A863 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms