Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.64
Prdm2A2A7B5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prdm2A2A7B5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms