Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fbxo47A2A6H3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fbxo47A2A6H3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms