Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm6268A2A3U9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm6268A2A3U9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms