Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms