Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms