Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Gm28171A0A087WQ19 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Gm28171A0A087WQ19 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm28171A0A087WQ19 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Gm28171A0A087WQ19 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gm28171A0A087WQ19 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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Gm28171A0A087WQ19 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm28171A0A087WQ19 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm28171A0A087WQ19 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gm28171A0A087WQ19 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm28171A0A087WQ19 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm28171A0A087WQ19 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm28171A0A087WQ19 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gm28171A0A087WQ19 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm28171A0A087WQ19 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm28171A0A087WQ19 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm28171A0A087WQ19 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm28171A0A087WQ19 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm28171A0A087WQ19 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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Gm28171A0A087WQ19 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm28171A0A087WQ19 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gm28171A0A087WQ19 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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