Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Hdac5Q9Z2V6 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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