Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Mir135b-201ENSMUST00000083501 97 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Rabgef1Q9JM13 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rabgef1Q9JM13 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rabgef1Q9JM13 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rabgef1Q9JM13 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rabgef1Q9JM13 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Rabgef1Q9JM13 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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