Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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Usp29Q9ES63 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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