Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Cldn22Q9D7U6 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Cldn22Q9D7U6 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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