Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Paf1Q8K2T8 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Paf1Q8K2T8 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms