Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 1700029M03Rik-202ENSMUST00000187517 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms