Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
NischQ80TM9 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms