Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GcsamQ6RFH4 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms