Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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BC051142Q3V0M8 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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BC051142Q3V0M8 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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BC051142Q3V0M8 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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BC051142Q3V0M8 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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BC051142Q3V0M8 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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BC051142Q3V0M8 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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BC051142Q3V0M8 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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BC051142Q3V0M8 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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BC051142Q3V0M8 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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BC051142Q3V0M8 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BC051142Q3V0M8 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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