Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gjb2Q00977 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 AC153557.1-201ENSMUST00000217697 403 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gjb2Q00977 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms