Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm17140-201ENSMUST00000169163 627 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Hoxd13P70217 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Hoxd13P70217 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms