Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
VdrP48281 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11934-201ENSMUST00000132553 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
VdrP48281 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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