Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Usp4P35123 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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