Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Odf3l1-201ENSMUST00000055036 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Rgs13-201ENSMUST00000052375 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Mtf1-201ENSMUST00000030723 7631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Hoxd9P28357 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Hoxd9P28357 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Hoxd9P28357 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hoxd9P28357 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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