Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Gm3415J3QMS8 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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