Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
XntrpcF8VQM8 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms