Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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PtprbB2RU80 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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PtprbB2RU80 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PtprbB2RU80 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PtprbB2RU80 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PtprbB2RU80 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PtprbB2RU80 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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PtprbB2RU80 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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PtprbB2RU80 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 E130101E03Rik-201ENSMUST00000214469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PtprbB2RU80 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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