Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm17173-201ENSMUST00000168000 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CtcflA2APF3 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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