Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdac5Q9Z2V6 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hdac5Q9Z2V6 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms