Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29053-201ENSMUST00000187484 370 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37712-201ENSMUST00000194295 647 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43590-201ENSMUST00000195987 387 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm42763-201ENSMUST00000199595 2087 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29918-202ENSMUST00000206036 258 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rabgef1Q9JM13 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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