Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Rnf6Q9DBU5 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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Rnf6Q9DBU5 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf6Q9DBU5 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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