Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Med27Q9DB40 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Med27Q9DB40 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms