Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gtf3c6Q9D8P7 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms