Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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